牡丹的主要病虫害包括多种病害和虫害，具体如下：
病害
- 灰霉病：导致植株叶片、花蕾等部位出现灰色霉层，并造成组织软腐。
- 褐斑病（红斑病）：引起叶片早枯，影响生长势。
- 炭疽病：常使牡丹叶片产生枯斑连片，病茎扭曲，幼嫩枝条枯死。
- 轮斑病（白星病）：主要为害叶片，发病初期会出现圆形或近圆形的淡褐色至灰白色病斑。
- 枝枯病：侵染茎干和枝条，导致其上部迅速死亡。
- 根结线虫病：造成根系形成瘤状物，严重影响植株生长，甚至导致死亡。
- 黄叶病：由于磷元素缺乏导致，表现为叶片发黄，从基部老叶开始逐渐脱落。
- 菌核病（茎腐病）：危害根茎，导致其腐烂。
虫害
- 介壳虫：吸取植物汁液，导致叶片变黄，枝梢枯萎。
- 天牛：幼虫钻蛀根茎髓部，严重时可致植株衰弱或死亡。
- 黄刺蛾：取食树叶下表皮和叶肉，造成叶片损伤。
- 蛴螬：地下害虫，咬食牡丹根部，造成凹凸不平的缺刻或孔洞。
- 地老虎：春秋季为害最重，常咬断幼苗或未出土的幼芽。
- 蝼蛄：啃食根皮和嫩芽、幼苗。
- 蚜虫：吸取植物汁液，导致叶片卷曲变形。
- 螨类：吸食叶片汁液，导致叶片褪绿、黄化甚至落叶。
对于这些病虫害，通常需要采取综合防治措施，包括选用抗病品种、合理的栽培管理、化学药剂的应用以及生物防治方法等。定期检查植株健康状况，及时发现并处理问题，是预防和控制病虫害的关键。